Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSH5O43196 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MSH5O43196 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
MSH5O43196 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
MSH5O43196 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
MSH5O43196 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MSH5O43196 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MSH5O43196 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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