Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SH3BP4Q9P0V3 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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