Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
FOXD1Q16676 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
FOXD1Q16676 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
FOXD1Q16676 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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