Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FXNQ16595 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FXNQ16595 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FXNQ16595 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
FXNQ16595 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FXNQ16595 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
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FXNQ16595 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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FXNQ16595 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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FXNQ16595 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FXNQ16595 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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