Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SKIV2LQ15477 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SKIV2LQ15477 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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