Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SCARF1Q14162 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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