Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PDE3BQ13370 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PDE3BQ13370 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms