Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PHACTR1Q9C0D0 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms