Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ERV3-1Q14264 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms