Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
COL9A3Q14050 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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