Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LHX9Q9NQ69 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LHX9Q9NQ69 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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