Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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