Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00312Q9Y6C7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms