Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUBP2Q9Y5Y2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms