Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXBP1Q9Y5B6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms