Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms