Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
POLR1DQ9Y2S0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms