Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7AQ9UPZ6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms