Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZMYND8Q9ULU4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZMYND8Q9ULU4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms