Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNRF3Q9ULT6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNRF3Q9ULT6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms