Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRPF3Q9ULD4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms