Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMFRQ9UKV5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms