Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms