Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLKQ9UBT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms