Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC180Q9P1Z9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC180Q9P1Z9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms