Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKD2L1Q9P0L9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKD2L1Q9P0L9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms