Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF12Q9NZN5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms