Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MS4A12Q9NXJ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A12Q9NXJ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms