Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q9NX04 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q9NX04 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms