Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC4Q9NTJ3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC4Q9NTJ3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms