Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC4BQ9NT99 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms