Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC6A13Q9NSD5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms