Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SALL1Q9NSC2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SALL1Q9NSC2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms