Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31BQ9NQW1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms