Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC17Q9NP64 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms