Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F12Q9HCS2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F12Q9HCS2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms