Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC52A2Q9HAB3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC52A2Q9HAB3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms