Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms