Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD3Q9H7E2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms