Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC016598.1-201ENST00000340585 560 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 OR4A48P-201ENST00000531359 391 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms