Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms