Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM5Q9C035 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM5Q9C035 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms