Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TDRD1Q9BXT4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD1Q9BXT4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms