Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms