Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SALL3Q9BXA9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms