Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms