Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTA3Q9BTC8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms