Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT17Q9BSW7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT17Q9BSW7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms