Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms