Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms